ヴァ行は出現率が低い
[ヴ] の出現頻度というのはかなり低いので、カナ系配列ではヴァ行を打ちやすくしているものはあまり見かけません。それに対して、Qwertyローマ字入力は「ヴュ」を除いて2打で打てます。
ローマ字入力ではヴァ行はかなり優遇されているといえます。
したがって、ローマ字入力出身の私が打ちづらく感じるのはある意味当然ですが、それだけではない気がしました。
「バ」と「ヴァ」の微妙な関係
通常ヴァ行はバ行と交換可能です。 「ヴァージョン」を「バージョン」と書いて問題ないですし、むしろその方が多かったりします。それにも関わらず、バ行は2打、ヴァ行は4打というのでは、ヴァ行をひどくまどろっこしく感じるのも無理はないと思います。
この点の解決法としては、[ァィェォ] を1打化する、[ヴ] を1打化する、というものが考えられます。
打鍵数を考えれば、[ヴ] を1打化して小指伸などの悪位置に置くのが妥当でしょう。
（これでも、打鍵数はかなり妥協しなければなりません）
[じ] と [ぢ]、[づ] と [ず]
そうしてみると、[じ] と [ぢ]、[づ] と [ず]にも同じような問題があると思います。これらは発音上等価であることと、「ずつ」と「づつ」など、交換可能な場合があることなどから、打鍵コストを近づけたほうが良さそうな気がします。
[づ] と [ず]はどちらも低頻度同士なので、あまり問題にならないと思いますが、[じ] と [ぢ] は頻度上大きな開きがあるので、[ぢ] を打つのは少しまどろっこしく感じられると思います。
ただ、どちらも2打ではあるので、慣れでの対応で間に合う程度かもしれません。
クァ行の打ちやすさ
逆に打数が多くても問題なさそうなのが、クァ行です。外来音は1拍なので、なるべく3打以内にはとどめたい、できれば2打にしたいというところです。
しかし、クァ行は特殊で、「クォリティ」を「クオリティ」と表記するなど、ク＋ア行と交換可能な場合が多いです。
特に脳内発音がク＋ア行になっている人は、打数が多くてもまどろっこしくはならないでしょう。
（シークェンス≒シーケンスなどの例外が少し問題になるかもしれません。）
実際の配置では、[ヴ] をアンシフトに配置して、[ぢ]を少し良い位置に配置するといったところになりそうです。
